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Projektbeschreibung

Py_ContigViewer is a contig viewer, a stand alone
cross-platform desktop application that uses CAP3
alignments to graphically display and validate
candidate SNPs and InDels. It also simplifies PCR
oligo design in an interactive mode. The extended
mode provides the display of BLAST hits of
annotated sequences with intron positions for the
selected contig. Py_ContigViewer works in
conjunction with DIS (Deletion, Insertion,
Substitution) SNP discovery pipeline at
http://www.atgc.org/SNP_Discovery/.

Systemanforderungen

Die Systemvoraussetzungen sind nicht definiert
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2004-04-20 05:23
Apr_19_2004

Diese Version bietet transparente Daten zu den perlprimer Programm Transfer über ein Netzwerk-Socket. Es vereinfacht Oligo Design, weil es keine Notwendigkeit mehr zu laufen "Ziel speichern unter" / "offen" Dialoge. Es ermöglicht auch Konfiguration der Display Parameter mit Hilfe einer Konfigurationsdatei.
Tags: Minor feature enhancements
This release provides transparent data transfer to the PerlPrimer program via a network socket. It simplifies oligo design because there is no longer a need to run "save as" / "open as" dialogs. It also allows configuration of display parameters using a config file.

2004-03-26 05:50
Mar_25_2004

Diese Version erzeugt Ausgabedateien im FASTA-Format mit Informationen über ausgewählte Regionen Oligo Design, das direkt von der perlprimer Programm genutzt werden kann. Die Suchfunktion für Teilstrings wurde verbessert, und die Anzeige der Inhalte für GC% Konsensus-Sequenzen durchgeführt wurde.
Tags: Minor feature enhancements
This version generates output files in FASTA format with
information about selected regions for oligo design that
can be used directly by the PerlPrimer program. The
search function for substrings was improved, and
displaying of GC% content for consensus sequences was
implemented.

2004-03-16 20:25
Mar_12_2004

Tags: Initial freshmeat announcement

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