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Projektbeschreibung

Genpak is a small set of utilities designated to process DNA, RNA, and protein sequences in a very Un*x-like manner. This way, Genpak programs can be combined using pipes and redirections, as well as easily incorporated into CGI scripts. The utilities include a program for calculating GC content, Tm, translating DNA/RNA sequences into protein sequences, quick sequence retrieval, random sequence generation, and finding promoter sequences using a Hertz matrix.

Systemanforderungen

Die Systemvoraussetzungen sind nicht definiert
Information regarding Project Releases and Project Resources. Note that the information here is a quote from Freecode.com page, and the downloads themselves may not be hosted on OSDN.

2001-06-06 19:28
0.26

Zwei neue Werkzeuge wurden aufgenommen. Einer von ihnen stellt Codon-Usage der ORF ein, um eine optimale Codon-Usage einer Gruppe von Genen widerspiegeln, und die andere ist ein Werkzeug für die Berechnung der Codon-Usage Abweichung von einer Bevölkerung von Genen. Einige kleinere Bugs wurden ebenfalls behoben.
Tags: Minor feature enhancements
Two new utilities were added. One of them adjusts codon usage of an ORF to
reflect an optimal codon usage of a group of genes, and the other one is a tool
for calculating the codon usage deviation from a population of genes. Some
minor bugs were also fixed.

2001-02-15 21:18
0.25

Diese Version behebt die zerbrochenen gp_tm, die zum Teil defekt gp_primer und andere kleinere Probleme.
Tags: Minor bugfixes
This release fixes the broken gp_tm, the partly broken gp_primer, and other minor problems.

2001-02-12 21:29
0.24

Diese Veröffentlichung fügt ein Programm für die Vorhersage von Oligonukleotid-Stem-Loop-Strukturen und dimeres.
Tags: Minor feature enhancements
This release adds a program for predicting oligonucleotide stem-loop structures and dimeres.

2001-02-10 01:25
0.23

Wichtige Bugfixes, Aufräumarbeiten, und einige neue Features.
Tags: Major bugfixes
Major bugfixes, code cleanups, and some new features.

2001-01-30 15:12
0.20

Viele Fehler wurden behoben, einige Dienstprogramme wurden neu geschrieben, und drei neue Programme wurden hinzugefügt.
Many bugs have been corrected, some utilities have been rewritten, and three new programs have been added.

Project Resources

Project Page Download: Änderungsprotokoll Homepage Download: RPM Download: TGZ