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Projektbeschreibung

Plasmidb is a database management system for
manipulating, viewing, and storing molecular biology
information rapidly and easily. It is capable of
handling constructed plasmids, clones, standard
vectors, primers, antibiotics, enzymes, and more.

Systemanforderungen

Die Systemvoraussetzungen sind nicht definiert
Information regarding Project Releases and Project Resources. Note that the information here is a quote from Freecode.com page, and the downloads themselves may not be hosted on OSDN.

2008-12-21 01:45
0.9

Weitere Daten können nun mit diesem Release eingeführt werden. Das Interface hat in Teilen wurde aufgeräumt. JavaScript-Funktionalität ist für das Aufräumen von DNA-Sequenzen aufgenommen. Ein Logger wurde hinzugefügt, um Fehler abzufangen. Weitere Seiten wurden hinzugefügt. Die angeforderte Funktion des Hinzufügen von Verzeichnissen auf den Pfad wurde hinzugefügt. (Diese können nun in app.conf eingestellt werden). Weitere PDF-Dateien können die Daten verknüpft werden. Excel-Dateien verknüpft werden, um Daten ceertain.
Tags: Major bugfixes
More data can now be inserted with this release.
The interface has been tidied up in parts.
JavaScript functionality has been added for
tidying up DNA sequences. A logger was added to
catch errors. More pages were added. The requested
feature of adding directories to the path was
added. (This can now be set in app.conf). More
PDFs can be linked to data. Excel files can be
linked to ceertain data.

2007-06-29 11:15
0.8

Diese Version bietet Verbesserungen der Benutzeroberfläche, ein CSS Restyle, Rahmen und viele Verbesserungen. PDF-Karten können nun leicht auf die Liste der Standard-Plasmide eingefügt und viele kommerzielle Plasmide sind in der Standard-Datenbank aufgenommen. Dies ist das letzte Release vor der Migration auf Ruby on Rails.
Tags: Major feature enhancements
This version provides interface improvements, a
CSS restyle, and many framework improvements. PDF
maps can now be added easily to the list of
standard plasmids and many commercial plasmids are
included in the standard database. This is the
last major release before migrating to Ruby on
Rails.

2007-05-07 03:36
0.7

Weitere Verbesserungen an der Benutzeroberfläche sind in dieses Release eingeflossen, mit weiteren Verknüpfung von DB-Tabellen. Icons ermöglichen es dem Benutzer jetzt, um das Element der Zinsen aus einer Tabelle, die eine Seite auf einer anderen Seite abfragt. Eine grundlegende SOAP-Schnittstelle wurde geschrieben, um dem Benutzer zu ermöglichen align Sequenzierung Daten mit dem Vektor gewünschten Reihenfolge für die Überprüfung.
Tags: Major feature enhancements
Additional improvements to the UI have been incorporated into this release, with further linking of DB tables. Icons now allow the user to select the item of interest from one table, which selects a page on a different page. A basic SOAP interface has been written to allow the user to align sequencing data with the vector desired sequence for verification.

2006-10-16 03:09
0.6

Diese Version ist eine große Umgestaltung, Vereinfachung einige der Komponenten veröffentlicht früher, und mit Hilfe eines Object Relational-Mapper (ORM) von PHP / PEAR. Datenbank-Abfragen sind jetzt so einfach wie $ sequence-> name = "RPP1"; $ sequence-> save; Verbesserungen im Datenmodell ermöglicht komplexe Komponenten hinzugefügt oder gelöscht werden, mit einem "Überblick" Seite zu zeigen, welche Untereinheiten sind in jedes Multi-Protein-Komplex.
Tags: Major feature enhancements
This release is a major redesign, simplifying some of the components released earlier, and using an Object Relational Mapper (ORM) from PHP/PEAR. Database queries are now as simple as $sequence->name = "Rpp1"; $sequence->save; Improvements in the data model allow complex components to be added or deleted, with an 'overview' page, to show which subunits are in each multi-protein complex.

2006-07-27 19:36
0.5

Verbesserungen in der Verzeichnis-Hierarchie sowie Model-View-Controller-Trennung. Weitere Daten werden automatisch von der DNA hergestellt kodierenden Sequenzen, zum Beispiel Eiweiße Molekulargewichte und Extinktionskoeffizienten. BioPHP hat eine bessere Objekt-Orientierung, und nutzt jetzt PHPUnit2 für die automatische Unit-Tests.
Tags: Major feature enhancements
Improvements in the directory hierarchy, as well as model view controller separation. More data is produced automatically from DNA coding sequences, for example protein molecular weights and extinction coefficients. Biophp has better object orientation, and now uses PHPUnit2 for automatic unit testing.

Project Resources

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